Im Jahr 2007 stand zur Bekämpfung nur noch Danadim Progress (Dimethoat, Restmengen) und das Produkt Mospilan (Acetamiprid, Genehmigung nach §11 PflSchG, Gefahr im Verzug) zur Verfügung. Verschiedene alternative Wirkstoffe wie Pyrethrine oder Thiacloprid, die zur Blattlausbekämpfung im Steinobst eingesetzt werden können, haben zwar eine z. T. gute Nebenwirkung gegen die Kirschfruchtfliege, doch ihre Anwendung ist im Hinblick auf die derzeitige Zulassungssituation problematisch und damit unbefriedigend. Gelbtafeln, die zur Überwachung des Flugbeginns und zur Einschätzung der vorhandenen Populationsdichte eingesetzt werden, sind für eine direkte Bekämpfung der Kirschfruchtfliege nicht geeignet. Bei einem Ausfall einer wirksamen und regelmäßigen Bekämpfung ist mit einem raschen Anwachsen der Kirschfruchtfliegenpopulationen in den Anbaugebieten zu rechnen, durch die der Befallsdruck und damit das Risiko eines Ernteverlustes steigen. Eine Vermarktung auch nur gering befallener Kirschen ist für den Anbauer nicht möglich, da der Handel eine Vermadung nicht akzeptiert.